Les incidències de caràcter funcional (diferències d'interpretació de la normativa, desconeixement de l'ús de l'aplicació, suggeriment de millora funcional…), es notificaran als responsables funcionals de la Secretaria General de Fons Europeus.Les incidències causades per un funcionament de l'aplicació incorrecte o diferent de l'esperat (inclosos problemes relacionats amb els serveis d'interoperabilitat) s'utilitzarà la mateixa via que en el cas anterior. Després de la seva anàlisi en destinació, el problema serà canalitzat a la Divisió V d'Aplicacions de Fons Europeus, responsable del disseny i construcció de l'aplicació.