Dona suport a les competències de l'Estat com a Autoritat de Gestió o Autoritat de Certificació als diferents programes operatius de Cooperació Territorial Europea per al període 2014-2020.
La iniciativa comunitària de Cooperació Territorial Europea o INTERREG es va dissenyar amb l'objectiu que les fronteres nacionals no anessin un obstacle ni al desenvolupament equilibrat ni a la integració del territori europeu. Perseguia, també, una acció integrada de cara al desenvolupament econòmic i a la cohesió econòmica i social. Es finança a través del Fons Europeu de Desenvolupament Regional articulant-se en una sèrie de Programes Operatius que funcionen en règim de cofinançament, amb subvencions a fons perdut aprovades per a una sèrie de projectes (operacions) que es transfereixen al beneficiari una vegada que aquest demostra el desemborsament de la quantitat aprovada i en els termes establerts.
El percentatge de cofinançament aconsegueix un màxim del 85%, encara que es negocia per Programa Operatiu en cada cas.